光遇海底宫殿的生态系统是一个充满神秘与动态交互的水下世界，环境光线较为暗淡，玩家在进入前需要确保光翼能量充足以维持飞行稳定性。宫殿入口由弧形拱门和石柱群标识，内部采用分层结构，上层观景平台可俯瞰发光水母群和悬浮遗迹残骸构成的海底景观，下层则通过周期性开启的中央漩涡通道进入，潜水时需注意氧气消耗并通过接触蓝色气泡及时补充。
生物元素在生态系统中扮演重要角色，发光水母群在黑暗水域中摇曳，为环境增添梦幻色彩，而发光珊瑚丛则作为临时氧气补给站，但其亮度会随时间衰减，要求玩家把握利用时机。这些自然景观不仅美化场景，也引入了资源管理的挑战，间歇性水流会改变移动轨迹，建议贴近墙壁规避强流，使得探索过程既视觉丰富又需策略应对。
氧气系统是生态系统的核心机制，玩家下潜时需持续关注氧气条，蓝色气泡散布在路径中供补充，中央漩涡通道的周期性开启要求玩家快速反应，增加了探索的紧张感。宫殿最深处的封闭区域需要双人协作激活机关才能进入，这种设计强调了社交互动，让玩家在适应环境变化中体验团队合作的重要性。
海底宫殿的生态系统还延伸至其他水底景点，如雨林终点的镜面水面、霞谷冰湖的半冰半水状态以及禁阁悬浮水域的隐藏区域，每个地方的水面效果和互动机制各异。玩家需掌握潜水操作，通过屏幕右侧的下潜键切换状态，并利用视角转动控制方向，以适应不同环境的独特生态特点，这些多样性让每次探索都充满新鲜感。
